Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Lrriq1Q0P5X1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Lrriq1Q0P5X1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Lrriq1Q0P5X1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Lrriq1Q0P5X1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Lrriq1Q0P5X1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrriq1Q0P5X1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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