Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms