Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TrioQ0KL02 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms