Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms