Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700061G19RikQ08EE8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms