Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms