Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs3Q05895 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms