Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Emx2Q04744 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms