Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nf1Q04690 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nf1Q04690 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms