Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1sQ02789 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms