Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gjb4Q02738 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms