Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms