Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VcpQ01853 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VcpQ01853 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VcpQ01853 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms