Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cacna1cQ01815 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms