Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms