Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms