Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms