Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms