Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms