Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Itga4Q00651 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms