Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GabpaQ00422 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms