Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pax8Q00288 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms