Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama4P97927 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama4P97927 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms