Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LystP97412 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LystP97412 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LystP97412 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LystP97412 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LystP97412 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LystP97412 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms