Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb2P81069 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms