Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx3P81067 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx3P81067 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms