Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms