Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Irf3P70671 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Irf3P70671 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf3P70671 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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