Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Hoxd13P70217 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxd13P70217 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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