Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl39P62892 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms