Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms