Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Csrnp3P59055 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms