Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P58686 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P58686 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P58686 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms