Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samsn1P57725 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samsn1P57725 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms