Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp25P57080 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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