Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CartptP56388 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CartptP56388 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms