Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3bp1P55194 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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