Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacnb3P54285 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb3P54285 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms