Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Map3k1P53349 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms