Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Efnb1P52795 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms