Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa6P50704 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms