Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LtbrP50284 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms