Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtshP49935 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtshP49935 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtshP49935 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtshP49935 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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