Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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