Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx1P48377 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms