Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VdrP48281 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VdrP48281 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms