Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms