Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tnfsf9P41274 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tnfsf9P41274 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf9P41274 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms