Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lig1P37913 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms