Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddit3P35639 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms